Využití FTIR spektroskopie pro detekci rakovinných nádorů ve vzorcích tkáně prostaty (matematická analýza dat)
Obor: Matematika, Biologie, ekologie a životní prostředí
Typ: počítačový
Supervizor: RNDr. Ondřej Pavlačka, Ph.D.
archivovaný projekt (projekt byl dořešen a uzavřen)
K dispozici je sada obrázků anotovaných vzorků prostatické tkáně, u kterých patolog vyznačil regiony, kde se vyskytuje nádorový a nenádorový epitel a nádorové a nenádorové stroma. Zároveň jsou k těmto vzorkům naměřená tzv. FTIR spektra (aplikací metody infračervené spektroskopie s Fourierovou transformací) v podobě číselných vektorů přiřazených k jednotlivým pixelům na obrázcích. Cílem bude sestavit klasifikační model, který na základě naměřených FTIR spekter dokáže co nejpřesněji automaticky rozpoznat regiony výskytu výše zmíněných 4 typů tkáně.