Výzkumná témata: Katedra biochemie

Mechanismy obrany rostlin a jejich kontrola

Role reaktivních forem kyslíku a dusíku (ROS, RNS) v obranné reakci během patogeneze a procesů rezistence v rostlinách
Role ROS a RNS v obranné reakci rostlin vystavených abiotickým stresovým faktorům (např. slanost, teplota, těžký kov)
Role ROS a RNS během regenerace rostlin z protoplastů
Role S-nitrosylace a S-nitrosoglutathionreduktasy v signálních drahách rostlin
Role ROS a RNS v rostlinné odpovědi na vybrané mikrobiální elicitory
Nitrace a nitrosylace proteinů působením reaktivních forem dusíku 
Úloha posttranslačních modifikací proteinových cysteinů v signálních drahách sulfanu během rostlinných odpovědí stresové faktory

Purifikace a kvantifikace antimikrobiálních peptidů včel
Testování antimikrobiální aktivity peptidů a dalších látek proti různým kmenům bakterií
Výzkum imunitního systému včel v reakci na patogeny či parazity
Analýza příčin ztrát včelstev, www.coloss.cz

Sója jako model pro ostatní organismy
Aplikovaná genomika – transfer metod pro zlepšování nutričních a agronomických vlastností ostatních luštěnin
Vývoj metody GWAS pro identifikaci genů v organismech s omezeným množstvím a kvalitou genomických dat
Vývoj bioinformatických nástrojů pro práci s velkými daty: SNPViz (http://soykb.org/newSNPViz/), AccuTool (http://soykb.org/AccuTool/index.php), Soybean Allele Catalog (http://soykb.org/GenescapeAnalysis/search.php), Sequence Guide dog (http://soykb.org/GenescapeAnalysis/allele_catalog_tool.php) (Python, Perl, R)
Transkriptomika, transgenoze, produkce rekombinantních proteinů

Hmotnostní spektrometrie v analýze proteinů - identifikace proteinů (peptidové mapování a peptidové sekvencování), relativní a absolutní kvantifikace a analýza posttranslačních modifikací (glykosylace, fosforylace)
Studium enzymů, zejména rostlinného a mikrobiálního původu, např. dehydrogenasy, oxidasy a proteas
Studium enzymů zapojených v metabolismu polyaminů