Členové katedry se aktivně podílejí na výchově pregraduálních i postgraduálních studentů jako vedoucí jejich bakalářských, diplomových a disertačních prací. Témata pokrývají širokou oblast od analytické, organické a medicinální chemie, přes biochemii až k buněčné a strukturní biologii. Jsou vhodná zejména pro studenty experimentální biologie, ale po domluvě lze nabídnout témata i pro další příbuzné studijní obory (biochemie, molekulární a buněčná biologie, biotechnologie a genové inženýrství, bioorganická chemie a chemická biologie). Po dokončení kvalifikační práce by studenti měli být schopni samostatně řešit problematiku designu a přípravy nových organických sloučenin, charakterizovat jeich fyzikálněchemické vlastnosti, stanovovat jejich koncentrace v biologických materiálech, studovat jejich účinky na živé systémy na různých úrovních (od molekulární, přes buněčnou a tkáňovou až k celému organismu), analyzovat vztahy mezi strukturou a biologickou aktivitou látek. Celé studium tak poskytne možnosti proniknout do výzkumu a praktických aplikací biologicky aktivních látek z pohledu syntézy, molekulárního mechanismu účinku a reálného použití.

Níže uvedený výběr prací vedených členy katedry v posledních 2-3 letech může sloužit jako vodítko pro studenty při volbě jejich školitele a tématu. Kompletní seznam a plné texty obhájených prací jsou dostupné na vyžádání u vedoucího, přes informační systém IS/STAG UP (práce obhájené v roce 2019, 2020, 2021, 2022, 2023 a 2024) nebo v databázi theses.cz.